Um Japão do futuro que se transformou em ruínas. Maru e Kiruko continuam sua jornada ao Paraíso, cuja localização eles não sabem.
Em busca de pistas, a dupla chega em Tóquio e decide juntar dinheiro para suas próximas ações. Enquanto isso, na escola cercada por muros verdes e altos, onde Tokio vive, um estranho fenômeno começa a acontecer: as crianças são acometidas por uma doença desconhecida. A cada mistério desvendado desse mundo, a complexidade se aprofunda. Sobreviva nesse mundo devastado!